Die Sängerin und Schülerin Hoshino Ichika ist gerade in einem Plattenladen in Shibuya, als sie ein Lied der Musikerin Hatsune Miku hört, das sie noch nicht kennt. Als sie wenige Tage später die Bekanntschaft einer alternativen Version von Miku macht, wird sie in ein großes Abenteuer verwickelt. Es scheint, als hätte diese Version von Miku Probleme, die Menschen mit ihrer Musik zu erreichen. Tatsächlich bittet sie Ichika um Hilfe.